O Plano Diretor da Unidade (PDU) é resultado do Planejamento Estratégico. Um trabalho realizado por meio de ampla consulta a 1.652 pessoas de 65 instituições dos Estados do que compõem o Semi-Árido brasileiro, que têm em comum a preocupação com o desenvolvimento regional.
No documento estão contidas as metas a serem alcançadas pelo Instituto no próximo quadriênio (2008 - 2011).